Abysses, imagine l'humanité menacée par l'apocalypse à cause de la pollution, avec les océans et ceux qui les peuplent se retournant contre les humains. En très peu de temps, toute vie humaine est en jeu – et le sort de l'ensemble de la population mondiale repose entre les mains d'un petit groupe de scientifiques.

L'action se déroule plusieurs années après les événements relatés dans le film. Au royaume enchanté des fées et du dragon à deux têtes Eborsisk, de nouveaux personnages feront leur apparition, mais on retrouvera également Willow Ufgood, le nain amateur de magie.

Après avoir pris une nouvelle drogue, Nora se réveille d'un coma sans aucun souvenir. A la recherche de sa mémoire perdue, la jeune femme découvrira les dessous d'une conspiration extraterrestre.